Para evitar fricciones con el General Alfredo Ovando Candia, un antiguo rival que estaba al mando de las Fuerzas Armadas, un 26 de mayo de 1965, René Barrientos inventó la copresidencia, que fue ejercida por ambos hasta su postulación como candidato para las elecciones nacionales, que recién se realizaron en 1966.

Durante el gobierno de Barrientos.  Se produjeron conflictos con los trabajadores luego de que el gobierno dictó un decreto ley que determinó la rebaja de salarios y el despido masivo de obreros considerados supernumerarios. El 26 de mayo de 1965, en Milluni, el ejército ingresó a los campamentos mineros para imponer el orden, lo hizo con gran violencia, incluso fue apoyado por aviones Mustang de la Fuerza Aérea.  En las minas grandes, la violencia desatada produjo numerosas bajas y se apreso a varios dirigentes.

Tal como sucedió en las jornadas de mayo de 1951, los obreros de las fábricas tomaron las zonas de Munaypata, Pura Pura, Villa Victoria y otras acciones violentas.  Al igual que en las minas, el ejército actuó sin contemplaciones.  Los enfrentamientos dejaron un saldo de 19 muertos y 80 heridos.  Barrientos amenazó con combatir con todas las armas ante la posibilidad de una “guerra civil”, además de aplastar a los rebeldes con la movilización de 10.000 campesinos en La Paz.

El 7 de septiembre de 1965, Barrientos rechazó la oferta de los campesinos del valle cochabambino para crear el partido político Movimiento Revolucionario Campesino y asumir su jefatura.  Esta fue la primera vez que este sector planteaba construir un partido político desde su seno, lo que demuestra que no siempre estuvieron dispuestos a servir de furgón de cola del régimen.